2-Carb-33. Glikozidok és glikozil-vegyületek
A glikozidokat eredetileg a monoszacharidok gyűrűs formáiból származó vegyes acetálokként (vagy ketálokként) definiálták.
Példa:
Később a "glikozid" elnevezést kiterjesztették olyan esetekre is, amelyekben az anomer hidroxilcsoportot nem -OR, hanem -SR (tioglikozidok), -SeR (szelenoglikozidok), -NR1R2 (N-glikozidok), sőt -CR1R2R3 (C-glikozidok) csoport helyettesítette. A "tioglikozid" és "szelenoglikozid" elfogadott általános kifejezések, de az "N-glikozid" elnevezés, bár a biokémiai szakirodalomban elterjedt, nem megfelelő és használatát nem ajánljuk (helyette a "glikozilamin" a megfelelő név). A "C-glikozid" elnevezés még kevésbé elfogadható (l. a 2-Carb-33.7 szabályhoz fűzött megjegyzést). A "glikóz" alapú kifejezések listáját l. a Függelékben.
Azokat az ROH típusú vegyületeket, amelyekből a szénhidrátrészt eltávolították, különösen a természetben előforduló glikozidok esetében, aglikonnak nevezzük, míg a szénhidrátrészt néha glikonnak.
A glikozidokat három különböző módon nevezhetjük el:
(a) A monoszacharid gyűrűs formájának "-óz" végződését "-ozid"-ra cseréljük(34) és az R-csoport nevét kötőjellel illesztjük az így képzett név elé (l. a példákat).
Példák:
Etil-b-D-fruktopiranozid
Metil-(6R)-D-glüko-hexodialdo-6,2-piranozid
Megjegyzés: Ez a glikozidok elnevezésének "klasszikus" módja. Főleg akkor használjuk, ha az R-csoport viszonylag egyszerű (pl. metil, etil, fenil). Megjegyzés: Ez az előtag nem foglalja magában a glikozidos kötés oxigénatomját. Ez a megfelelő eljárás a természetes vegyületek elnevezésére, ha a triviális név magában foglalja a hidroxilcsoportot. Ezt a rendszert az oligoszacharidok elnevezésére is használjuk (l. 2-Carb-37 szabályt). Példák:
(b) A "glikoziloxi-" kifejezés használatával: az elnevezéshez a monoszacharid megfelelő formáját alkalmazzuk előtagként.
Megjegyzés: Ez az előtag magában foglalja a glikozidos kötés oxigénatomját. A 2-Carb-31.2 szabályban bemutattunk egy példát, továbbiakat l. később.
(c) Az "O-glikozil" kifejezést a hidroxivegyület előtagjaként használva.
Megjegyzés: Az általános biokémiai gyakorlatban a (20S)-3a-(b-D-glükopiránuronoziloxi)-5b-pregnán-20-ol névvel találkozhatunk. Az uronsavakból származó glikozilmaradékok megnevezésére alkalmazott "glikuronozil" név nem megfelelő, mert feltételezi a "glikuronóz" alapnevet. A funkciós csoportnévvel végződő szubsztituens-előtag (glikoziloxiuronsav) alkalmazása az általános szerves kémiai nevezéktan elveivel [13, 14] ellentétes. Ez utóbbi eljárás azzal az előnnyel rendelkezik, hogy megtartja a glikózok és a glikuronsavak közötti homomorf viszonyt.
(S)-O-b-D-Glükopiranozilmandelonitril
vagy (S)-(b-D-glükopiranoziloxi)(fenil)acetonitril;
triviális név: szambunigrin
7-(b-D-Glükopiranoziloxi)-8-hidroxikumarin; triviális név: dafnin
O3-b-D-Xilopiranozil-L-szerin [(Xil-)Ser]
A glikozidokat a 2-Carb-31 szabály alapján szubsztitutensként is elnevezhetjük.
Példa:
Az egyes vegyületek nevét, hasonlóan a glikozidokéhoz, háromféleképpen képezhetjük.
(a) A tioglikozid és az azt megelőző R-csoport nevének alkalmazásával.
(b) A "glikoziltio-" előtag segítségével, amelyet az RH vegyület neve követ; ez az előtag magában foglalja a kénatomot.
(c) Az "S-glikozil" előtag (amely nem foglalja magában a kénatomot) és a tiovegyület nevének használatával.
A szulfoxidokat és szulfonokat a funkcióscsoportok nevezéktana alapján [13, 14] is elnevezhetjük.
Példák:
4-(a-D-Ribofuranoziltio)benzoesav
vagy 4-karboxifenil-1-tio-a-D-ribofuranozid
S-b-D-Glükopiranozil-(Z)-O-(kálium-szulfonáto)but-3-én-hidroximotioát
(triviális név: szinigrin)
Fenil-tetra-O-acetil-a-D-glükopiranozil-szulfoxid
vagy fenil-2,3,4,6-tetra-O-acetil-1-tio-a-D-glükopiranozid-S-oxid
A vegyületek nevét a tioglikozidokéval analóg módon képezzük (l. 2-Carb-33.3).
Példák:
Se-b-D-Ribopiranozil-D-szelenocisztein
vagy (S)-2-amino-2-karboxietil-1-szeleno-b-D-ribopiranozid
vagy 3-(b-D-ribopiranozilszeleno)-D-alanin
Az anomer hidroxilcsoport halogénatomra történő cseréjével képződő vegyületeket glikozil-halogenideknek nevezzük. A pszeudohalogenidek (azidok, tiocianátok stb.) nevét hasonló módon képezzük.
Példák:
Metil-(2,3,4-tri-O-acetil-a-D-glükopiranozil)uronát-bromid
nem metil-2,3,4-tri-O-acetil-1-bromo-1-dezoxi-a-D-glükopiránuronát
3,4,6-Tri-O-benzil-a-D-arabino-hexopiranozil-2-ulóz-bromid
3,4,5-Tri-O-benzil-a-D-arabino-hexoz-2-ulo-2,6-piranozil-bromid
vagy 3,4,5-tri-O-benzil-aldehido-a-D-arabino-hexoz-2-ulopiranozil-bromid
Metil-(5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetil-3,5-didezoxi-D-glicero-a-D-galakto-non-2-ulopiranozil)onát-klorid
33.6. N-glikozil-vegyületek (glikozilaminok)
Az N-glikozil-származékokat glikozilaminokként nevezzük el. Bonyolult heterociklusos aminok, pl. nukleozidok estében ugyanezt az eljárást használjuk.
Példák:
1-b-D-Ribofuranoziluracil
(triviális név: uridin)
N1-(2-Acetamido-2-dezoxi-b-D-glükopiranozil)-L-lizinamid ()
[triviális név: N1-(N-acetilglükozaminil)-L-lizinamid]
9-(5-S-Metil-5-tio-b-D-ribofuranozil)adenin
N4-(2-Acetamido-2-dezoxi-b-D-glükopiranozil)-L-aszparagin [(GlcNAc-)Asn]
vagy 2-acetamido-N1-L-b-aszparaginil-2-dezoxi-b-D-glükopiranozilamin
(triviális név: b-N-acetilglükozaminil-L-aszparagin)
Bisz(a-D-glükopiranoziluronamid)amin
A glikozidos hidroxilcsoportból és egy szénatomhoz kapcsolódó hidrogénből formálisan vízkilépéssel képződő, C-C kötést tartalmazó vegyületeket a megfelelő "glikoziloxi-" előtag használatával nevezzük el (vagy más megfelelő módszerrel, hogy elkerüljük a "C-glikozid" terminológiát).
Megjegyzés: A pszeudouridin (a transzfer RNS-ből származó nukleozid) nevéből eredő C-glikozid elnevezés téves névadáson alapul. Minden más glikozid hidrolizálható, a "C-glikozidok" C-C kötése általában nem. A "C-glikozid" terminológiára épülő nevek használatát és terjesztését ezért határozottan helytelenítjük.
Példák:
8-(2-dezoxi-b-D-eritro-pentofuranozil)adenin
nem adenin-8-(2-dezoxiribozid)
5-b-D-Ribofuranoziluracil; triviális név: pszeudouridin
3,7-Anhidro-2-dezoxi-D-glicero-D-gulo-oktononitril
vagy 2-C-(b-D-glükopiranozil)acetonitril
nem cianometil-C-b-D-glükopiranozid
2-b-D-glükopiranozil-1,3,6,7-tetrahidroxixanten-9-on; triviális név: mangiferin
(10S)-10-b-D-glükopiranozil-1,8-dihidroxi-3-(hidroximetil)antracen-
9(10H)-on; triviális nevek: aloin A, (10S)-barbaloin
6-b-D-glükopiranozil-4',5,7-trihidroxi-8-a-L-ramnopiranozilflavon;
triviális név: violantin